Controle de contaminação é o conjunto de ações e medidas para controlar a entrada ou proliferação de particulados ou microrganismos em ambiente controlado.

O controle de contaminação envolve também técnicas de limpeza, uso de materiais e equipamentos específicos para manter os níveis de contaminação dentro dos padrões exigidos.

A prevenção é o meio mais eficaz para controlar a contaminação. A prevenção de contaminantes que atingem as áreas críticas de processamento deve ser o objetivo das estratégias de controle de contaminação.

A prevenção completa pode nem sempre ser prática ou viável; no entanto, deve continuar a ser um alvo de melhoria contínua em cada local. A estratégia de prevenção deve incluir o estabelecimento de um programa bem definido e organizado, começando com uma boa compreensão do processo de fabricação do produto estéril, avaliações objetivas de risco com foco nas variáveis do processo e fontes de contaminação, estabelecendo critérios e métricas de aceitação alcançáveis, meios para monitorar o desempenho e um plano para ajustar a estratégia conforme necessário.